More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0039 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1493 bp  2960    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1493 bp  2960    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1536 bp  724    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  84.32 
 
 		 1509 bp  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1505 bp  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1505 bp  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1505 bp  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1505 bp  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 1541 bp  617  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 1541 bp  617  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 1527 bp  615  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 1527 bp  615  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 1527 bp  615  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 1466 bp  609  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1506 bp  609  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 1431 bp  609  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 1466 bp  609  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  81.68 
 
 		 1431 bp  601  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1526 bp  569  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1525 bp  553  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0057  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1531 bp  535  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.501783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0038  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1531 bp  535  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.966561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 1513 bp  535  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1498 bp  521  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1498 bp  521  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1512 bp  502  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1510 bp  502  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1510 bp  502  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1692 bp  494  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1692 bp  494  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 1568 bp  462  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1532 bp  460  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1532 bp  460  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 1568 bp  462  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1532 bp  460  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1532 bp  460  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0029  16S ribosomal RNA  81.9 
 
 		 1519 bp  446  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.247127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0013  16S ribosomal RNA  81.9 
 
 		 1519 bp  446  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0052  16S ribosomal RNA  81.9 
 
 		 1519 bp  446  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0363262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1505 bp  444  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1505 bp  444  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0045  16S ribosomal RNA  81.81 
 
 		 1520 bp  432  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000645163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1612 bp  422  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1544 bp  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1544 bp  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1544 bp  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1544 bp  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  82 
 
 		 1521 bp  408  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1555 bp  400  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 1521 bp  400  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 1521 bp  400  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 1521 bp  400  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_De16S  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1435 bp  396  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.56338  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0032  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1509 bp  396  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000103754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1497 bp  385  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1497 bp  385  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1497 bp  385  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1546 bp  383  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1530 bp  383  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1689 bp  383  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1502 bp  383  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1545 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1545 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1545 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1545 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1545 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_893  16S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 1490 bp  375  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.11071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1544 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1546 bp  375  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1544 bp  367  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1544 bp  367  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1544 bp  365  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1501 bp  361  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1501 bp  361  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1501 bp  361  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0034  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1536 bp  357  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0062  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1536 bp  357  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0027  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1536 bp  357  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.075558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0056  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1536 bp  357  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 1503 bp  357  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  88.69 
 
 		 1500 bp  355  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>