More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0032 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_De16S  16S ribosomal RNA  98.75 
 
 		 1435 bp  2702    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.56338  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0032  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1509 bp  2991    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000103754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_893  16S ribosomal RNA  98.93 
 
 		 1490 bp  2827    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.11071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 1521 bp  466  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1505 bp  460  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 1479 bp  462  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 1479 bp  462  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1505 bp  460  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 1479 bp  462  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1521 bp  458  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1521 bp  458  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1521 bp  458  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1509 bp  456  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  82.85 
 
 		 1479 bp  454  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1498 bp  452  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1498 bp  452  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1517 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1518 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1518 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1522 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1517 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1474 bp  432  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1474 bp  432  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1523 bp  418  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1512 bp  412  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1512 bp  412  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1512 bp  412  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0027  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1511 bp  408  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0044  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1511 bp  408  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1493 bp  396  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1493 bp  396  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  82.26 
 
 		 1524 bp  391  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 		 1431 bp  391  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 		 1431 bp  391  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 		 1466 bp  391  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  82.26 
 
 		 1524 bp  391  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 		 1466 bp  391  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0029  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 		 1507 bp  389  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000204422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0011  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 		 1507 bp  389  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0991443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  81.99 
 
 		 1533 bp  385  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1533 bp  377  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1533 bp  377  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1477 bp  375  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1477 bp  375  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1478 bp  375  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1477 bp  375  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 1479 bp  371  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 1479 bp  371  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 1479 bp  371  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12340  16S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 1527 bp  367  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0023  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1513 bp  367  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0040  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1513 bp  367  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07380  16S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 1527 bp  367  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0389035  normal  0.172558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  89.27 
 
 		 1465 bp  351  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  88.99 
 
 		 1490 bp  347  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  88.99 
 
 		 1490 bp  347  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1498 bp  343  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1465 bp  343  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 1488 bp  339  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 1490 bp  339  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 1488 bp  339  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 1490 bp  339  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0042  16S ribosomal RNA  81.48 
 
 		 1515 bp  337  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0519048  normal  0.0131861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0027  16S ribosomal RNA  81.48 
 
 		 1515 bp  337  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 1465 bp  335  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 1465 bp  335  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0048  16S ribosomal RNA  87.99 
 
 		 1484 bp  335  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.23 
 
 		 1555 bp  331  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 1401 bp  327  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 1465 bp  327  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 1401 bp  327  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0040  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1499 bp  321  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.509918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0031  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1499 bp  321  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1479 bp  321  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1479 bp  321  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>