More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0041 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1543 bp  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 		 1477 bp  1822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1479 bp  2932    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 1465 bp  1441    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1394 bp  1348    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 		 1488 bp  1871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 		 1490 bp  1871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 		 1488 bp  1871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 		 1490 bp  1871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1540 bp  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1479 bp  1421    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  87.54 
 
 		 1458 bp  1382    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1440 bp  1354    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1440 bp  1354    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 		 1465 bp  1433    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1490 bp  1774    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1490 bp  1774    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1535 bp  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1535 bp  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1540 bp  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1479 bp  2924    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1540 bp  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1482 bp  1925    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1482 bp  1925    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1543 bp  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1543 bp  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1543 bp  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 1548 bp  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1540 bp  670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 1548 bp  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 1548 bp  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1479 bp  2932    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 1548 bp  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  92.23 
 
 		 1479 bp  2006    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 1479 bp  1998    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  91.82 
 
 		 1474 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  92.23 
 
 		 1479 bp  2006    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  91.82 
 
 		 1474 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1479 bp  2932    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 		 1478 bp  1816    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 		 1477 bp  1822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 		 1477 bp  1822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 1465 bp  1441    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1465 bp  1425    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  88 
 
 		 1465 bp  1449    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  87.89 
 
 		 1401 bp  1338    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  87.89 
 
 		 1401 bp  1338    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1498 bp  1475    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1563 bp  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1563 bp  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1551 bp  632  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1551 bp  632  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0013  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0073  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0620583  hitchhiker  0.00094865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0051  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  0.139607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0044  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418237  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0076  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  626  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  626  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1538 bp  624  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1537 bp  624  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0029  16S ribosomal RNA  81.32 
 
 		 1476 bp  620  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392184  hitchhiker  0.00162521 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1538 bp  617  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1538 bp  617  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1530 bp  567  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1689 bp  567  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1502 bp  567  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0052  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0079  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0066  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0923471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0035  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0021  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0041  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0008  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1472 bp  561  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1473 bp  555  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1473 bp  555  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1545 bp  555  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1545 bp  555  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1639 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1641 bp  537  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  83.45 
 
 		 1641 bp  529  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1555 bp  529  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0059  16S ribosomal RNA  80.4 
 
 		 1475 bp  527  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66406  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0029  16S ribosomal RNA  80.4 
 
 		 1475 bp  527  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0070  16S ribosomal RNA  80.34 
 
 		 1487 bp  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0033  16S ribosomal RNA  80.34 
 
 		 1487 bp  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0056  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1529 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000107545  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SB  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1518 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SE  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1518 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197165  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1544 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0001  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1529 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166692  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1546 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0099  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1529 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000444541  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0001  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1549 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000584792  normal  0.761928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0009  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1549 bp  513  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805602  hitchhiker  0.000585754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>