More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0029 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1482 bp  1624    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1482 bp  1624    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 1465 bp  1285    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 		 1401 bp  1199    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 1465 bp  1285    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 1479 bp  1998    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 		 1401 bp  1199    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 1479 bp  1998    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 1465 bp  1300    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1478 bp  1538    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 1498 bp  1320    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1479 bp  2924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 1479 bp  1998    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  92.23 
 
 		 1479 bp  2006    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1477 bp  1544    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1477 bp  1544    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.73 
 
 		 1474 bp  1683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  86.62 
 
 		 1394 bp  1181    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1488 bp  1544    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1490 bp  1544    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1488 bp  1544    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1490 bp  1544    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1479 bp  1344    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1458 bp  1304    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 1440 bp  1285    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 1440 bp  1285    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1479 bp  2924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 1477 bp  1544    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1479 bp  2932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 1465 bp  1287    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1465 bp  1279    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1490 bp  1631    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1490 bp  1631    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.73 
 
 		 1474 bp  1683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1545 bp  579  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1545 bp  579  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1548 bp  569  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1563 bp  569  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1548 bp  569  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  82.46 
 
 		 1538 bp  571  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  82.55 
 
 		 1535 bp  569  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1548 bp  569  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1548 bp  569  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1563 bp  569  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  82.55 
 
 		 1535 bp  569  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  82.46 
 
 		 1538 bp  571  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1538 bp  563  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1537 bp  563  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 1543 bp  561  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 1543 bp  561  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 1543 bp  561  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 1543 bp  561  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1546 bp  549  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1546 bp  547  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1540 bp  545  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1540 bp  545  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1540 bp  545  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1544 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  81.05 
 
 		 1501 bp  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  81.05 
 
 		 1501 bp  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  81.05 
 
 		 1501 bp  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1544 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1544 bp  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  82.18 
 
 		 1540 bp  537  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1554 bp  537  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1671 bp  537  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1661 bp  537  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.24 
 
 		 1521 bp  535  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  83.24 
 
 		 1521 bp  535  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  83.24 
 
 		 1521 bp  535  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.24 
 
 		 1521 bp  535  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1548 bp  525  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1548 bp  525  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1555 bp  521  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1554 bp  513  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1554 bp  513  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1555 bp  505  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1551 bp  500  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1551 bp  500  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1551 bp  500  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1551 bp  500  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  82.37 
 
 		 1555 bp  498  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1518 bp  492  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1518 bp  492  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1518 bp  492  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1518 bp  492  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1518 bp  492  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1530 bp  486  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1502 bp  486  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1689 bp  486  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1551 bp  480  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1551 bp  480  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1509 bp  476  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1509 bp  476  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1509 bp  476  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1509 bp  476  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1509 bp  476  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>