More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_r22 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1554 bp  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1554 bp  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1554 bp  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1554 bp  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 1554 bp  710    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1554 bp  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1509 bp  757    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1509 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1509 bp  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1509 bp  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  84.94 
 
 		 1508 bp  775    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1508 bp  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  85.02 
 
 		 1562 bp  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1548 bp  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1548 bp  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1548 bp  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1510 bp  757    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1510 bp  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1510 bp  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1510 bp  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1510 bp  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1509 bp  779    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 1555 bp  817    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1510 bp  757    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1509 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1509 bp  787    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1503 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1503 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1503 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1503 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1510 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1510 bp  781    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1510 bp  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1507 bp  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1507 bp  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1507 bp  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1507 bp  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1507 bp  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1507 bp  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  85.04 
 
 		 1506 bp  779    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SK  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1507 bp  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1477 bp  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1477 bp  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1477 bp  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1477 bp  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1479 bp  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1479 bp  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0065  16S ribosomal RNA  82.66 
 
 		 1479 bp  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1543 bp  692    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1579 bp  714    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1522 bp  2983    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1517 bp  2976    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1522 bp  2983    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1522 bp  2991    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  99.67 
 
 		 1522 bp  2976    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1522 bp  2991    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1518 bp  2976    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1518 bp  2983    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  99.61 
 
 		 1522 bp  2970    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  99.67 
 
 		 1522 bp  2977    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  99.61 
 
 		 1522 bp  2970    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  99.67 
 
 		 1522 bp  2977    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1522 bp  2985    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  99.47 
 
 		 1522 bp  2954    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1522 bp  2985    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1522 bp  3017    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1522 bp  2985    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1517 bp  2976    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  85.02 
 
 		 1530 bp  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  85.02 
 
 		 1689 bp  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  85.02 
 
 		 1502 bp  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1548 bp  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1548 bp  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>