More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0052 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1479 bp  1631    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1479 bp  1631    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1477 bp  1564    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1477 bp  1564    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  88.66 
 
 		 1478 bp  1558    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  90.73 
 
 		 1465 bp  1798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  90.8 
 
 		 1465 bp  1806    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 1465 bp  1784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1479 bp  1774    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  91.28 
 
 		 1474 bp  1850    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  91.46 
 
 		 1401 bp  1802    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1479 bp  1774    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 1479 bp  1766    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1477 bp  1564    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1479 bp  1631    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1394 bp  1661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1488 bp  1653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1490 bp  1653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1488 bp  1653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1490 bp  1653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  91.46 
 
 		 1401 bp  1802    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1465 bp  1782    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  91.02 
 
 		 1479 bp  1842    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1458 bp  1802    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  91 
 
 		 1440 bp  1792    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  91 
 
 		 1440 bp  1792    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1498 bp  1836    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  91.28 
 
 		 1474 bp  1850    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  90.73 
 
 		 1465 bp  1798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1490 bp  2954    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1490 bp  2954    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1479 bp  1774    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 1482 bp  1689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 1482 bp  1689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1548 bp  607  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1548 bp  607  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1521 bp  587  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1521 bp  587  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1521 bp  587  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1521 bp  587  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1612 bp  583  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1612 bp  583  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1612 bp  583  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1612 bp  583  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1479 bp  577  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1479 bp  577  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0065  16S ribosomal RNA  80.98 
 
 		 1479 bp  577  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1612 bp  575  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  82.25 
 
 		 1554 bp  575  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1563 bp  573  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1612 bp  575  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1612 bp  575  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1563 bp  573  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1612 bp  575  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  82.25 
 
 		 1554 bp  575  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  82.41 
 
 		 1545 bp  563  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  82.41 
 
 		 1545 bp  563  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1548 bp  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1548 bp  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1548 bp  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4504  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1485 bp  559  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1548 bp  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4501  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1485 bp  559  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6504  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1485 bp  559  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6501  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1485 bp  559  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1544 bp  555  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  81.97 
 
 		 1661 bp  551  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  81.97 
 
 		 1554 bp  551  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  81.97 
 
 		 1671 bp  551  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 1545 bp  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 1544 bp  547  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>