More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0016 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 1477 bp  1388    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1479 bp  1354    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1479 bp  1277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1479 bp  1354    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 1479 bp  1346    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 1479 bp  1285    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1479 bp  1277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1474 bp  1596    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1478 bp  1382    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 1477 bp  1388    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1479 bp  1354    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  96.27 
 
 		 1394 bp  2345    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1488 bp  1455    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1490 bp  1455    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1488 bp  1455    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 1490 bp  1455    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  99.44 
 
 		 1479 bp  2791    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  99.44 
 
 		 1458 bp  2787    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1440 bp  2855    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1440 bp  2855    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 1477 bp  1388    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  96.6 
 
 		 1465 bp  2458    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  91 
 
 		 1490 bp  1792    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  91 
 
 		 1490 bp  1792    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  96.39 
 
 		 1465 bp  2434    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  97.36 
 
 		 1465 bp  2545    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  97.93 
 
 		 1401 bp  2541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  96.39 
 
 		 1465 bp  2434    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  96.6 
 
 		 1465 bp  2458    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  97.93 
 
 		 1401 bp  2541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 1482 bp  1398    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 1482 bp  1398    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  96.53 
 
 		 1498 bp  2450    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1474 bp  1596    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 		 1555 bp  617  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1612 bp  553  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1612 bp  537  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1612 bp  537  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1612 bp  537  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1612 bp  537  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1535 bp  533  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1535 bp  533  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1536 bp  523  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1556 bp  519  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 1587 bp  521  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 1587 bp  521  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1587 bp  513  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1587 bp  513  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1587 bp  513  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0302  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1509 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000398573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1509 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5671  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1509 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000020932 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1510 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1521 bp  507  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1554 bp  507  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1554 bp  507  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1521 bp  507  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000398584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5685  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5630  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0540044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5289  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0602543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5041  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000406275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5616  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.162347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5694  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0644845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5691  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5675  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5683  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5690  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5231  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  hitchhiker  0.0000000000104089 
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1507 bp  504  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1507 bp  504  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 1587 bp  505  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5688  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5669  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1509 bp  504  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>