More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0024 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 
1554 bp  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 
1554 bp  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 
1554 bp  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 
1554 bp  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 
1554 bp  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 
1554 bp  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1508 bp  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1508 bp  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1508 bp  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1509 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1508 bp  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1509 bp  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1508 bp  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1509 bp  769    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1509 bp  769    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1508 bp  767    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1508 bp  767    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 
1562 bp  793    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 
1551 bp  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1509 bp  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 
1555 bp  799    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1509 bp  781    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1509 bp  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1503 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1503 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1503 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1503 bp  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1510 bp  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1510 bp  779    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 
1471 bp  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 
1471 bp  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1548 bp  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 
1548 bp  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1507 bp  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1507 bp  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1507 bp  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1507 bp  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1507 bp  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1507 bp  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 
1506 bp  775    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SK  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1507 bp  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  85.79 
 
 
1555 bp  1068    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0024  16S ribosomal RNA  86.22 
 
 
1515 bp  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0041  16S ribosomal RNA  86.22 
 
 
1515 bp  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00000734371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 
1517 bp  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 
1517 bp  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 
1517 bp  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 
1517 bp  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 
1517 bp  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  83.35 
 
 
1555 bp  755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  83.35 
 
 
1555 bp  755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 
1509 bp  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0021  16S ribosomal RNA  86.22 
 
 
1515 bp  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.222363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0038  16S ribosomal RNA  86.22 
 
 
1515 bp  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000160883  decreased coverage  0.00357812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0027  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 
1515 bp  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0042  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 
1515 bp  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0519048  normal  0.0131861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  82.28 
 
 
1541 bp  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 
1541 bp  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 
1541 bp  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 
1541 bp  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 
1541 bp  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  85.55 
 
 
1521 bp  831    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  85.65 
 
 
1521 bp  839    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>