More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0014 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 1479 bp  1631    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1479 bp  1624    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 1479 bp  1631    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 1394 bp  1257    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 		 1488 bp  1853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 		 1490 bp  1853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 		 1488 bp  1853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 		 1490 bp  1853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  91.68 
 
 		 1479 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1479 bp  1447    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  87.69 
 
 		 1458 bp  1407    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 1440 bp  1398    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 1440 bp  1398    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1479 bp  1925    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  87.53 
 
 		 1465 bp  1404    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  91.06 
 
 		 1474 bp  1859    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 1465 bp  1396    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 1490 bp  1689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 1490 bp  1689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1482 bp  2938    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1482 bp  2938    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1479 bp  1925    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1477 bp  1737    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1477 bp  1737    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1478 bp  1739    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1477 bp  1737    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1540 bp  644    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1479 bp  1925    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  91.06 
 
 		 1474 bp  1859    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 1465 bp  1388    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 1465 bp  1358    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 1465 bp  1388    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1401 bp  1310    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1401 bp  1310    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  87.58 
 
 		 1498 bp  1423    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 1540 bp  636  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 1540 bp  636  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 1540 bp  636  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1639 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1641 bp  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1535 bp  622  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1535 bp  622  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 1641 bp  618  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 1538 bp  607  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 1538 bp  607  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1612 bp  605  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1612 bp  605  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1612 bp  605  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1612 bp  605  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  82.85 
 
 		 1538 bp  599  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1530 bp  599  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1689 bp  599  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1502 bp  599  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  82.85 
 
 		 1537 bp  599  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1612 bp  597  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1563 bp  597  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1612 bp  597  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1612 bp  597  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1563 bp  597  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1612 bp  597  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1554 bp  591  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1555 bp  591  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1661 bp  591  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1671 bp  591  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 1554 bp  583  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 1554 bp  583  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1548 bp  581  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1548 bp  581  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1548 bp  581  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1548 bp  581  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1548 bp  577  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1548 bp  577  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1543 bp  571  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1543 bp  571  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1543 bp  571  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1543 bp  571  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  82.07 
 
 		 1536 bp  553  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  81.69 
 
 		 1556 bp  537  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  82.58 
 
 		 1551 bp  527  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  82.58 
 
 		 1551 bp  527  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1479 bp  523  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1479 bp  523  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0065  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1479 bp  523  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1526 bp  523  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1525 bp  525  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1525 bp  525  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1543 bp  515  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1548 bp  513  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1548 bp  513  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1548 bp  513  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1548 bp  513  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1543 bp  515  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1521 bp  515  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1521 bp  515  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1521 bp  515  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>