More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0018 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1548 bp  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1548 bp  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1554 bp  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 1554 bp  1156    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1554 bp  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1554 bp  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 1554 bp  1156    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  87.45 
 
 		 1554 bp  739    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1473 bp  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1473 bp  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1562 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1544 bp  1168    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1545 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1555 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1541 bp  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1551 bp  837    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  86.48 
 
 		 1544 bp  1152    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1544 bp  1168    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1612 bp  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1612 bp  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  1160    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1549 bp  767    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  84.88 
 
 		 1587 bp  739    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1587 bp  731    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1555 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 1545 bp  1170    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  1160    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  1160    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1545 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1562 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1807  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000448863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1551 bp  837    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  1160    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1541 bp  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1541 bp  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1497 bp  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1801  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000298169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  92.4 
 
 		 1612 bp  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1612 bp  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1541 bp  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1612 bp  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  92.4 
 
 		 1612 bp  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1612 bp  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  92.4 
 
 		 1612 bp  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1541 bp  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1549 bp  767    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 1562 bp  1170    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1555 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1587 bp  731    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  85.09 
 
 		 1587 bp  741    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1587 bp  724    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1587 bp  731    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1563 bp  846    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1545 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1545 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  86.88 
 
 		 1545 bp  1162    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1563 bp  846    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 		 1471 bp  803    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  87.13 
 
 		 1548 bp  898    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  87.13 
 
 		 1548 bp  898    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  82.93 
 
 		 1519 bp  811    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0020  16S ribosomal RNA  83 
 
 		 1504 bp  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0056  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1489 bp  799    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0079  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1501 bp  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1549 bp  767    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1549 bp  767    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1620  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0929772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1551 bp  837    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1551 bp  837    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1497 bp  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1496 bp  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1566  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1579 bp  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  87.69 
 
 		 1555 bp  1308    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1544 bp  1168    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1544 bp  1168    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0013  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 1495 bp  743    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000161102  normal  0.413867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0043  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 1534 bp  743    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000126976  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1517 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1522 bp  696    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1518 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1518 bp  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1522 bp  712    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1522 bp  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1522 bp  696    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1522 bp  712    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1522 bp  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1522 bp  696    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1517 bp  712    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 1530 bp  1023    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 1689 bp  1023    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 1502 bp  1023    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>