More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0036 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  86.62 
 
 		 1479 bp  1181    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.26 
 
 		 1474 bp  1507    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.26 
 
 		 1474 bp  1507    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 1479 bp  1174    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 1479 bp  1174    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  99.5 
 
 		 1465 bp  2708    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  97.56 
 
 		 1401 bp  2494    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  98.21 
 
 		 1465 bp  2565    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  98.35 
 
 		 1465 bp  2581    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 1477 bp  1289    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1479 bp  1340    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 1478 bp  1283    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 1477 bp  1289    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 1477 bp  1289    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1479 bp  1348    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1394 bp  2763    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1488 bp  1348    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1490 bp  1348    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1488 bp  1348    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1490 bp  1348    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  96.63 
 
 		 1479 bp  2385    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  96.63 
 
 		 1458 bp  2385    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  96.27 
 
 		 1440 bp  2345    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  96.27 
 
 		 1440 bp  2345    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1479 bp  1348    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  98.42 
 
 		 1465 bp  2589    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  97.56 
 
 		 1401 bp  2494    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1479 bp  1348    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  97.99 
 
 		 1465 bp  2541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1490 bp  1661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1490 bp  1661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  98.21 
 
 		 1498 bp  2565    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 1482 bp  1257    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 1482 bp  1257    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 1556 bp  575  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1587 bp  569  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1587 bp  569  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1587 bp  569  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1535 bp  559  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1587 bp  561  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1587 bp  561  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1535 bp  559  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1587 bp  561  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 1526 bp  551  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1555 bp  533  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1549 bp  525  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 1528 bp  525  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1549 bp  525  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1549 bp  525  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1549 bp  525  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1525 bp  519  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1525 bp  519  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1807  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000448863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1801  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000298169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1620  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0929772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1566  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 1579 bp  517  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 1612 bp  515  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 1543 bp  507  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 1543 bp  507  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1554 bp  504  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1554 bp  504  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1545 bp  505  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1521 bp  504  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1538 bp  504  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1537 bp  504  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1550 bp  505  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1545 bp  505  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1550 bp  505  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1521 bp  504  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1521 bp  504  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1521 bp  504  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55170  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000502422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55140  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55110  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0208311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1540 bp  502  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  81.75 
 
 		 1501 bp  502  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1540 bp  502  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1540 bp  502  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  81.75 
 
 		 1501 bp  502  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1540 bp  502  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  81.75 
 
 		 1501 bp  502  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55000  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00013378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55030  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55060  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1538 bp  496  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1538 bp  496  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1532 bp  498  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1532 bp  498  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1545 bp  492  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1545 bp  492  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1545 bp  492  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>