More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0053 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1477 bp  2418    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 
1479 bp  1871    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 
1479 bp  1544    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  88.37 
 
 
1479 bp  1552    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  88.63 
 
 
1465 bp  1524    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  87.95 
 
 
1465 bp  1445    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  88.02 
 
 
1465 bp  1453    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 
1401 bp  1398    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1477 bp  2418    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1478 bp  2413    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 
1401 bp  1398    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  88.23 
 
 
1498 bp  1497    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  88.02 
 
 
1465 bp  1453    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 
1394 bp  1348    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1488 bp  2950    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1490 bp  2954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1488 bp  2950    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1490 bp  2954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 
1479 bp  1871    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  88.47 
 
 
1479 bp  1513    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 
1458 bp  1473    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 
1440 bp  1455    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  88.31 
 
 
1440 bp  1455    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  87.95 
 
 
1465 bp  1445    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 
1490 bp  1653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 
1490 bp  1653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 
1474 bp  1852    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 
1474 bp  1852    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  91.28 
 
 
1479 bp  1879    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1477 bp  2418    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 
1482 bp  1853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  90.83 
 
 
1482 bp  1853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  88.37 
 
 
1479 bp  1552    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  91.22 
 
 
1479 bp  1871    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1540 bp  557  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1540 bp  557  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1540 bp  557  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1540 bp  557  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  81.88 
 
 
1535 bp  476  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  81.88 
 
 
1535 bp  476  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  85.95 
 
 
1537 bp  468  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  85.95 
 
 
1538 bp  468  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 
1538 bp  460  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 
1538 bp  460  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  81.34 
 
 
1525 bp  450  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0056  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1465 bp  452  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000698586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0014  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1465 bp  452  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000553365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  81.98 
 
 
1555 bp  450  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0007  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1561 bp  452  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0020  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1464 bp  452  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000408702  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  81.34 
 
 
1525 bp  450  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0001  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1465 bp  452  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000564687  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  81.46 
 
 
1543 bp  448  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  81.46 
 
 
1543 bp  448  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  83.05 
 
 
1530 bp  434  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  83.05 
 
 
1689 bp  434  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  83.05 
 
 
1502 bp  434  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 
1587 bp  430  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 
1587 bp  430  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 
1587 bp  422  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0002  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 
1527 bp  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00839807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0059  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 
1527 bp  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000001214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0016  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 
1527 bp  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0074  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 
1527 bp  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000232355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  83.45 
 
 
1587 bp  414  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  83.45 
 
 
1587 bp  414  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 
1587 bp  408  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55110  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0208311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55170  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000502422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55060  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55030  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55140  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55000  16S ribosomal RNA  81.14 
 
 
1535 bp  402  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00013378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  82.51 
 
 
1548 bp  392  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  82.51 
 
 
1548 bp  392  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  80.91 
 
 
1470 bp  392  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 
1556 bp  391  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  80.91 
 
 
1470 bp  392  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  80.91 
 
 
1459 bp  392  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  80.91 
 
 
1459 bp  392  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 
1548 bp  387  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 
1548 bp  387  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SC  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1518 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0265668  normal  0.0523023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0099  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000444541  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1518 bp  383  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1518 bp  383  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1518 bp  383  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0102  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000475362  normal  0.0274728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0001  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166692  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 
1548 bp  383  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 
1548 bp  383  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0014  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000281309  normal  0.538779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0004  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534371  normal  0.567436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0058  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207326  normal  0.764569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0021  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  hitchhiker  0.000111868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0018  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1549 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771769  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0064  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1538 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160038  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0031  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1549 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143019  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0089  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1529 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000457884  normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0009  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1549 bp  383  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805602  hitchhiker  0.000585754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>