More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0063 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 1568 bp  783    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1692 bp  710    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1692 bp  710    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  86.37 
 
 		 1532 bp  1021    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 1568 bp  783    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1510 bp  2993    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  99.67 
 
 		 1512 bp  2942    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  99.87 
 
 		 1510 bp  2977    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1532 bp  1029    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  86.37 
 
 		 1532 bp  1021    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1532 bp  1029    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 1533 bp  605  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1541 bp  599  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1541 bp  599  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1533 bp  597  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1533 bp  589  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1525 bp  581  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1526 bp  581  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1512 bp  563  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1512 bp  563  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1501 bp  555  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1501 bp  555  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1501 bp  555  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1466 bp  551  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1431 bp  551  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1509 bp  551  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1431 bp  551  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1466 bp  551  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1505 bp  539  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1505 bp  539  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1505 bp  539  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1505 bp  539  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 1513 bp  533  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0032  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1511 bp  529  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0044  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1511 bp  529  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0004  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1511 bp  529  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  84.47 
 
 		 1506 bp  525  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 1521 bp  517  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1519 bp  513  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1519 bp  513  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1519 bp  513  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1521 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1521 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1521 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0005  16S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 1528 bp  505  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.022366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0031  16S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 1528 bp  505  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00134109  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0043  16S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 1528 bp  505  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942291  normal  0.0921912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1493 bp  502  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1493 bp  502  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 1544 bp  496  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1505 bp  494  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 1544 bp  496  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 1544 bp  496  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1505 bp  494  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 1544 bp  496  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1612 bp  490  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1477 bp  484  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1477 bp  484  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1477 bp  484  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1477 bp  484  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0038  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1531 bp  486  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.966561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0057  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1531 bp  486  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.501783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0024  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1515 bp  480  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0021  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1515 bp  480  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.222363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0021  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1515 bp  480  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812892  normal  0.0276093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0038  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1515 bp  480  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00000101805  decreased coverage  0.0014476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0041  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1515 bp  472  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00000734371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0038  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1515 bp  472  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000160883  decreased coverage  0.00357812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0011  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1507 bp  466  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0029  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1507 bp  466  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000204422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0039  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1517 bp  456  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0163381  hitchhiker  0.00923101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0018  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1517 bp  456  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.298469  normal  0.903608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1508 bp  458  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1508 bp  458  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0036  16S ribosomal RNA  82.68 
 
 		 1512 bp  454  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0053  16S ribosomal RNA  82.68 
 
 		 1512 bp  454  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0060  16S ribosomal RNA  82.68 
 
 		 1512 bp  454  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.889945  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0063  16S ribosomal RNA  82.68 
 
 		 1512 bp  454  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1497 bp  452  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1497 bp  452  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1497 bp  452  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0029  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1513 bp  452  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0036  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1513 bp  452  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0017  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1513 bp  452  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0056  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1513 bp  452  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1523 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1523 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0080  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1513 bp  452  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1523 bp  452  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1359 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1359 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1359 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1359 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>