More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0016 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1508 bp  1255    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1508 bp  1255    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1563 bp  1511    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1568 bp  817    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1568 bp  817    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 1554 bp  1481    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1359 bp  2694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1359 bp  2694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1359 bp  2694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1359 bp  2694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1532 bp  585  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1532 bp  585  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1532 bp  577  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1532 bp  577  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  83.14 
 
 		 1692 bp  545  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  83.14 
 
 		 1692 bp  545  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1533 bp  521  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1533 bp  521  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1533 bp  521  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  80.88 
 
 		 1513 bp  456  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1512 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1510 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 1510 bp  450  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 1541 bp  355  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 1541 bp  355  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  86.83 
 
 		 1545 bp  333  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  86.83 
 
 		 1545 bp  333  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1545 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1545 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1545 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1544 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  86.56 
 
 		 1546 bp  325  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1546 bp  317  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1546 bp  317  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 1542 bp  307  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 1542 bp  307  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1431 bp  301  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1466 bp  301  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1466 bp  301  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1555 bp  295  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1548 bp  295  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1431 bp  293  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0052  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1500 bp  291  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.605716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0017  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1500 bp  291  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.16688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1473 bp  285  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1473 bp  285  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1470 bp  278  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1459 bp  278  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 1544 bp  278  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1459 bp  278  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 1544 bp  278  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  79.35 
 
 		 1548 bp  278  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  79.35 
 
 		 1548 bp  278  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  79.35 
 
 		 1548 bp  278  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  79.35 
 
 		 1548 bp  278  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 1544 bp  278  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 1544 bp  278  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1470 bp  278  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0027  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  274  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0048  16S ribosomal RNA  79.31 
 
 		 1493 bp  274  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0036  16S ribosomal RNA  79.31 
 
 		 1493 bp  274  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.594639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0009  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  274  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000875225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0030  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  274  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000520624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0060  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  274  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0049  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  274  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 1510 bp  270  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  82.18 
 
 		 1493 bp  268  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  82.18 
 
 		 1493 bp  268  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1566  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1620  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0929772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1801  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000298169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1807  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1579 bp  268  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000448863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0001  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1525 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1545 bp  262  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1545 bp  262  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1551 bp  262  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1503 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1503 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1510 bp  262  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>