More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0022 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1359 bp  817    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1359 bp  817    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 1532 bp  1065    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1532 bp  1057    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1692 bp  898    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1568 bp  3108    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1563 bp  864    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1359 bp  817    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1359 bp  817    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1532 bp  1057    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 1532 bp  1065    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1568 bp  3108    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 1510 bp  783    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 1555 bp  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 1510 bp  783    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1513 bp  1005    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 1512 bp  783    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1554 bp  870    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1692 bp  898    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1546 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1546 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1546 bp  593  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1546 bp  593  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1544 bp  591  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1530 bp  587  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1689 bp  587  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1544 bp  583  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1544 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1546 bp  585  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1502 bp  579  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1671 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1544 bp  569  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1544 bp  569  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1544 bp  569  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1544 bp  569  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1544 bp  561  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1544 bp  553  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0001  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1525 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0009  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1526 bp  539  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000875225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0027  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1526 bp  539  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0060  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1526 bp  539  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0030  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  535  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000520624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0049  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1526 bp  535  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 		 1536 bp  527  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1431 bp  523  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1466 bp  523  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1466 bp  523  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0062  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1536 bp  517  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0056  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1536 bp  517  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0034  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1536 bp  517  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0027  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1536 bp  517  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.075558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 1431 bp  515  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1612 bp  504  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1612 bp  504  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1612 bp  504  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1612 bp  504  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1541 bp  498  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1541 bp  498  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1541 bp  498  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1541 bp  498  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1541 bp  498  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1612 bp  496  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1545 bp  492  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1545 bp  492  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1550 bp  488  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1550 bp  488  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  484  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  484  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0006  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 		 1558 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000369599  normal  0.665449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0048  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00545182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0070  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.66024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0061  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.925308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0044  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0039  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 		 1558 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000267916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0083  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0095  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1559 bp  480  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00647588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 1521 bp  480  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 1521 bp  480  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0057  16S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 1559 bp  474  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000646504  normal  0.910143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1521 bp  474  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>