More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0002 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1541 bp  3055    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1541 bp  3055    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 1526 bp  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1532 bp  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1532 bp  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1532 bp  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1532 bp  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 1525 bp  636  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1513 bp  628  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 1493 bp  617  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 1493 bp  617  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1612 bp  609  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1431 bp  603  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1466 bp  603  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1431 bp  603  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1466 bp  603  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1512 bp  599  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1510 bp  599  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1510 bp  599  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85 
 
 		 1509 bp  587  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1501 bp  571  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1501 bp  571  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1501 bp  571  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 1521 bp  561  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1521 bp  553  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1521 bp  553  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1521 bp  553  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1505 bp  549  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1505 bp  549  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 1498 bp  547  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 1498 bp  547  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1512 bp  539  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1512 bp  539  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0029  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0070  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0036  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0056  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0080  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0017  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1513 bp  521  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0031  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1528 bp  509  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00134109  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0005  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1528 bp  509  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.022366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0043  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1528 bp  509  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942291  normal  0.0921912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1555 bp  507  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0042  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1508 bp  504  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0033  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1508 bp  504  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785728  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1519 bp  502  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1519 bp  502  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1519 bp  502  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1512 bp  486  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1512 bp  486  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 1522 bp  486  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1512 bp  486  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1517 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1518 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1518 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1517 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 1568 bp  448  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1546 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 1568 bp  448  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 1545 bp  440  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 1545 bp  440  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  436  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  436  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  436  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 1692 bp  436  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 1692 bp  436  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 1546 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  436  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1546 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1546 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1546 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>