More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1527 bp  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1527 bp  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 1497 bp  1897    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1512 bp  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1512 bp  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1513 bp  771    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1526 bp  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1505 bp  2960    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1527 bp  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1505 bp  2983    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 1498 bp  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 1497 bp  1897    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1500 bp  954    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85.67 
 
 		 1509 bp  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 1497 bp  1897    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1504 bp  1786    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 1498 bp  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1504 bp  1794    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1504 bp  1794    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  85.62 
 
 		 1525 bp  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1532 bp  613  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1532 bp  613  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1532 bp  613  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1532 bp  613  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0032  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1511 bp  599  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0044  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1511 bp  599  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0004  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1511 bp  599  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10550  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1527 bp  593  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06910  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1527 bp  593  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37140  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1527 bp  593  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22220  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1527 bp  593  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.755159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0039  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1517 bp  561  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0163381  hitchhiker  0.00923101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0018  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1517 bp  561  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.298469  normal  0.903608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0057  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1531 bp  527  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.501783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0038  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1531 bp  527  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.966561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1533 bp  525  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1533 bp  525  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1533 bp  525  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1431 bp  509  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1431 bp  502  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1466 bp  502  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1466 bp  502  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  83.36 
 
 		 1692 bp  462  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  83.36 
 
 		 1692 bp  462  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  86.75 
 
 		 1536 bp  448  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1493 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1493 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1563 bp  442  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1563 bp  442  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1551 bp  432  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1551 bp  432  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1551 bp  432  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1551 bp  432  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 1501 bp  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 1501 bp  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 1501 bp  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 1548 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 1548 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0013  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1519 bp  410  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0029  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1519 bp  410  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.247127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0052  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1519 bp  410  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0363262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1512 bp  406  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1512 bp  406  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1512 bp  406  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 1512 bp  404  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 1510 bp  404  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 1510 bp  404  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0045  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1520 bp  400  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000645163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1505 bp  400  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1505 bp  400  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1505 bp  391  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1505 bp  391  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1505 bp  391  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1505 bp  391  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0025  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1471 bp  387  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0044  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1471 bp  387  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0049  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1471 bp  387  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0067  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1471 bp  387  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  89.41 
 
 		 1519 bp  387  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  89.41 
 
 		 1519 bp  387  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  89.41 
 
 		 1519 bp  387  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1510 bp  385  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1510 bp  385  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1510 bp  385  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1510 bp  385  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1517 bp  385  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1517 bp  385  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1517 bp  385  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1517 bp  385  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1517 bp  385  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1546 bp  385  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1546 bp  385  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0036  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1512 bp  385  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0053  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1512 bp  385  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0060  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1512 bp  385  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.889945  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0063  16S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 1512 bp  385  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1546 bp  385  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1546 bp  385  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  89.05 
 
 		 1510 bp  385  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1546 bp  385  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>