More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0041 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0041  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1433 bp  2841    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1639 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 1641 bp  502  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 1521 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1517 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1521 bp  418  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1521 bp  418  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1521 bp  418  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1517 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1518 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1518 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1522 bp  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1471 bp  406  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1471 bp  406  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  82.5 
 
 		 1522 bp  408  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0047  16S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 1494 bp  387  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1554 bp  383  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1554 bp  383  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1554 bp  383  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1671 bp  383  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1661 bp  383  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1563 bp  375  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1548 bp  375  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1548 bp  375  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1563 bp  375  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  82.18 
 
 		 1509 bp  373  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  82.02 
 
 		 1505 bp  371  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  82.02 
 
 		 1505 bp  371  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  82.02 
 
 		 1505 bp  371  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  82.02 
 
 		 1505 bp  371  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1543 bp  367  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1543 bp  367  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1548 bp  367  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1548 bp  367  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1543 bp  367  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1548 bp  367  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1548 bp  367  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1543 bp  367  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 		 1512 bp  361  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1548 bp  359  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 		 1548 bp  359  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  81.9 
 
 		 1506 bp  357  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 1551 bp  353  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  81.89 
 
 		 1512 bp  353  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 1551 bp  353  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  81.89 
 
 		 1512 bp  353  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0048  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1559 bp  351  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00545182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0039  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1558 bp  351  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000267916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0061  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1559 bp  351  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.925308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0049  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1469 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0040  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1469 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0042  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1474 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.087372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0056  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1474 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0051  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1474 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0054  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1469 bp  349  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.859756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1554 bp  345  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1562 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1555 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1562 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1555 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1562 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1545 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1555 bp  345  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1510 bp  343  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0006  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1558 bp  343  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000369599  normal  0.665449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1510 bp  343  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1551 bp  343  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1510 bp  343  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1551 bp  343  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1510 bp  343  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1510 bp  343  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1551 bp  343  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>