More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0006 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  751    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0057  16S ribosomal RNA  99.49 
 
 		 1559 bp  3019    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000646504  normal  0.910143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.78 
 
 		 1545 bp  872    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0061  16S ribosomal RNA  99.49 
 
 		 1559 bp  3019    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.925308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  88.41 
 
 		 1661 bp  1090    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 		 1544 bp  827    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1546 bp  835    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0006  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1558 bp  3089    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000369599  normal  0.665449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1544 bp  833    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 1544 bp  743    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  841    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  841    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1546 bp  819    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0039  16S ribosomal RNA  98.2 
 
 		 1558 bp  2866    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000267916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0034  16S ribosomal RNA  97.31 
 
 		 1559 bp  2750    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.78 
 
 		 1545 bp  872    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0095  16S ribosomal RNA  99.36 
 
 		 1559 bp  3003    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00647588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0070  16S ribosomal RNA  98.65 
 
 		 1559 bp  2916    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.66024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  88.41 
 
 		 1554 bp  1090    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  88.41 
 
 		 1671 bp  1090    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  751    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 1555 bp  969    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 		 1544 bp  827    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0048  16S ribosomal RNA  99.55 
 
 		 1559 bp  3027    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00545182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1544 bp  751    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  841    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0083  16S ribosomal RNA  98.59 
 
 		 1559 bp  2908    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1536 bp  733    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0044  16S ribosomal RNA  98.46 
 
 		 1559 bp  2892    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  91.41 
 
 		 1612 bp  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  82.72 
 
 		 1555 bp  638  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  82.72 
 
 		 1555 bp  638  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 1554 bp  617  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 1554 bp  617  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1639 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1641 bp  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  89.31 
 
 		 1523 bp  565  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6504  16S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 1485 bp  543  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4501  16S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 1485 bp  543  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60062  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6501  16S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 1485 bp  543  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4504  16S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 1485 bp  543  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1532 bp  533  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1532 bp  533  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1532 bp  533  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1532 bp  533  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  88.32 
 
 		 1524 bp  533  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  88.32 
 
 		 1524 bp  533  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1545 bp  525  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1545 bp  525  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1509 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 1545 bp  525  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>