More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0036 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1509 bp  728    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5630  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0540044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  98 
 
 		 1641 bp  2981    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  98.05 
 
 		 1641 bp  2985    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1466 bp  872    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1523 bp  906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5313  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1523 bp  908    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1524 bp  884    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 1523 bp  914    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1523 bp  900    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1510 bp  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1523 bp  900    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1639 bp  3249    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1524 bp  884    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1523 bp  906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  98.05 
 
 		 1641 bp  2985    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  98.05 
 
 		 1641 bp  2985    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1431 bp  872    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1545 bp  749    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 1554 bp  1009    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5623  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00151087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5616  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.162347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1517 bp  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  87.09 
 
 		 1522 bp  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1518 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1518 bp  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 1522 bp  724    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  87.09 
 
 		 1522 bp  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1522 bp  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1522 bp  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 		 1522 bp  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1517 bp  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5041  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000406275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5231  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  hitchhiker  0.0000000000104089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000398584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5682  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5685  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5688  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5691  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5694  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0644845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  90.58 
 
 		 1554 bp  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  90.58 
 
 		 1554 bp  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 1661 bp  1009    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 1671 bp  1009    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  97.81 
 
 		 1641 bp  2958    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  98.17 
 
 		 1641 bp  3001    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5289  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0602543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  98.24 
 
 		 1641 bp  3013    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1431 bp  880    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  93.65 
 
 		 1521 bp  1304    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 1521 bp  1320    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  93.65 
 
 		 1521 bp  1304    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  93.76 
 
 		 1521 bp  1312    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1466 bp  872    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 1612 bp  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5669  16S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 1545 bp  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1509 bp  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1482 bp  626  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  81.84 
 
 		 1482 bp  626  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>