More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0033 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0033  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1549 bp  3071    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0046  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1549 bp  3071    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0028  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1513 bp  394  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00237559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0033  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1513 bp  394  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0017  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1513 bp  394  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1568 bp  283  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1568 bp  283  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1510 bp  278  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1512 bp  278  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1510 bp  278  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1533 bp  236  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1533 bp  236  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1533 bp  236  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0027  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1536 bp  222  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.075558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0034  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1536 bp  222  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0056  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1536 bp  222  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0062  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1536 bp  222  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1544 bp  212  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1493 bp  212  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1544 bp  212  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1544 bp  212  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1544 bp  212  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1493 bp  212  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1465 bp  206  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1465 bp  206  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1498 bp  206  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  79.56 
 
 		 1491 bp  204  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  79.56 
 
 		 1491 bp  204  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1543 bp  202  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1474 bp  202  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1543 bp  202  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1474 bp  202  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  79.22 
 
 		 1555 bp  202  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  79.22 
 
 		 1555 bp  202  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1465 bp  198  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1394 bp  198  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  82.77 
 
 		 1465 bp  198  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0007  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1538 bp  194  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 1497 bp  194  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 1497 bp  194  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 1497 bp  194  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 1563 bp  194  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 1563 bp  194  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0041  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1538 bp  194  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0625865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.45 
 
 		 1548 bp  194  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.45 
 
 		 1548 bp  194  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0002  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1544 bp  194  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0013  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1544 bp  194  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0059  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1538 bp  194  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1541 bp  194  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1541 bp  194  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1541 bp  194  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1541 bp  194  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1541 bp  194  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 1504 bp  190  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 1504 bp  190  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 1504 bp  190  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  82.46 
 
 		 1465 bp  190  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1541 bp  190  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1548 bp  190  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1548 bp  190  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1541 bp  190  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1548 bp  190  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1548 bp  190  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_De16S  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1435 bp  188  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.56338  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0032  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1509 bp  188  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000103754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0009  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1503 bp  188  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.00000000257641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0041  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1510 bp  188  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1490 bp  188  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1490 bp  188  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0006  16S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 1528 bp  186  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 1542 bp  186  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 1500 bp  186  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 1542 bp  186  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  79.01 
 
 		 1555 bp  184  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  79.01 
 
 		 1555 bp  184  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0123  16S ribosomal RNA  79.01 
 
 		 1555 bp  184  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0112353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  79.01 
 
 		 1555 bp  184  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1401 bp  182  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1401 bp  182  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1479 bp  182  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1458 bp  182  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1440 bp  182  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1440 bp  182  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 1530 bp  182  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 1689 bp  182  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 1502 bp  182  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  78.69 
 
 		 1555 bp  182  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  78.69 
 
 		 1555 bp  182  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  78.69 
 
 		 1555 bp  182  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0136  16S ribosomal RNA  78.69 
 
 		 1555 bp  182  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000629377  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  78.69 
 
 		 1555 bp  182  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1543 bp  180  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.84 
 
 		 1526 bp  180  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1543 bp  180  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1543 bp  180  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1543 bp  180  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAr03  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1454 bp  178  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1586  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1454 bp  178  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1022  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1454 bp  178  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>