More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0030 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 
1548 bp  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 
1548 bp  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1554 bp  739    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 
1554 bp  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1554 bp  739    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1554 bp  739    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 
1554 bp  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  84.25 
 
 
1554 bp  735    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1545 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1545 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1508 bp  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1508 bp  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1508 bp  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 
1509 bp  876    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1508 bp  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 
1509 bp  880    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1508 bp  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1509 bp  884    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 
1509 bp  884    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 
1508 bp  882    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 
1508 bp  882    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 
1562 bp  908    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 
1544 bp  1138    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  87.01 
 
 
1521 bp  950    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  87.01 
 
 
1521 bp  950    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 
1545 bp  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1545 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  87.01 
 
 
1521 bp  950    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  87.01 
 
 
1521 bp  950    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1510 bp  878    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1510 bp  878    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  86.51 
 
 
1510 bp  894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  86.51 
 
 
1510 bp  894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  86.51 
 
 
1510 bp  894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  86.51 
 
 
1510 bp  894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1509 bp  888    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 
1555 bp  892    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1510 bp  878    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1509 bp  888    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1509 bp  880    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  86.51 
 
 
1510 bp  894    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1503 bp  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1510 bp  878    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 
1503 bp  888    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1503 bp  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 
1503 bp  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 
1510 bp  886    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  86.79 
 
 
1544 bp  1146    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  86.78 
 
 
1544 bp  1150    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  86.79 
 
 
1544 bp  1146    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1555 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1545 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1555 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  86.78 
 
 
1544 bp  1150    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  86.78 
 
 
1544 bp  1150    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 
1507 bp  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 
1507 bp  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 
1507 bp  888    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 
1507 bp  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 
1507 bp  888    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 
1507 bp  888    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 
1507 bp  888    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 
1507 bp  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 
1506 bp  882    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  86.28 
 
 
1507 bp  872    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SK  16S ribosomal RNA  86.28 
 
 
1507 bp  872    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1562 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1562 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1545 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 
1562 bp  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 
1555 bp  870    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 
1555 bp  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 
1548 bp  751    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 
1555 bp  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 
1555 bp  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>