66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0432 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  64.79 
 
 		 280 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  64.44 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  44.59 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  41.02 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  43.67 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  42.74 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  43.35 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  42.92 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  39.35 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  42.74 
 
 		 271 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  42.74 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  39.18 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  38.63 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  39 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  40.93 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  42.42 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  39.66 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  42.61 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  37.97 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  35.34 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  34.05 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  41.94 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  34.26 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  38.62 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  32.73 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  25.27 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  24.32 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  27.84 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.43 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  27.47 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.46 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  27.39 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  25.7 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.38 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  26.11 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  26.09 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  24.64 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  26.12 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  25.21 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  26.38 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  26.84 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  21.68 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.9 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.9 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.4 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  22.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  21.89 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  23.96 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  22.53 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  23.01 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  23.12 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  22.93 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  22.22 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  22.22 
 
 		 407 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 355 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 355 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 355 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>