53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1670 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  98.52 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  97.05 
 
 		 271 aa  507  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  58.36 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  60.53 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  60.15 
 
 		 273 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  61.51 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  61.09 
 
 		 275 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  59.76 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  56.27 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  50.56 
 
 		 271 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  52.03 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  53.47 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  50.98 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  49.8 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  48.9 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  51 
 
 		 276 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  49.63 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  48.87 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  48.94 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  49.15 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  42.74 
 
 		 284 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  43.08 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  37.22 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  39.27 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  37.31 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.8 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  28.21 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  28.57 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  28.38 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  27.39 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  26.75 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  30.74 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  28.19 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.45 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  28.91 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  25.42 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  28.51 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.86 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  27.56 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.63 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.78 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  28 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  24.58 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  27.78 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.83 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  28.38 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  25.45 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  26.82 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  23.56 
 
 		 484 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  30.11 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>