65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6959 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  74.9 
 
 
258 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  54.01 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  58.44 
 
 
261 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  40.49 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  39.74 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  37.72 
 
 
274 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  34.65 
 
 
284 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  32.16 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  31.02 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  31.39 
 
 
286 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.7 
 
 
282 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.46 
 
 
294 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.46 
 
 
294 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  33.49 
 
 
285 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  33.8 
 
 
296 aa  99  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  30.8 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.31 
 
 
301 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  25.23 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  28.57 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  26.62 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  28.16 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  28.15 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  27.13 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  26.4 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  27.02 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.81 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.81 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  27.05 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  29.61 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.34 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  27.63 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  29.69 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  26.91 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  29.71 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  26.84 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  28.38 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  28.38 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  28.14 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  26.83 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  25.97 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.52 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  25.7 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  27.5 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  28.75 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  31.06 
 
 
343 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  24.45 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  26.56 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  20.81 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  26.15 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  29.63 
 
 
407 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  28.89 
 
 
407 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  29.51 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  27.46 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  27.27 
 
 
329 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  28.69 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  30.25 
 
 
675 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  28.41 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  27.73 
 
 
669 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  35.87 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  29.41 
 
 
675 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  28.41 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  35.87 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>