60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2863 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  65.53 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  52.19 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  45.42 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  42.33 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  38.96 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  37.63 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  42.33 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  40.37 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  37.69 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  37.66 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  39.67 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  39.67 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  39.26 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  36.73 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  37.66 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  37.66 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  42.65 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  35.55 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  38.64 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  38.64 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  35.29 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  41.8 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  35.75 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  38.62 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  30.43 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  27.57 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  28.28 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.49 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.1 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  27.71 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  27.1 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  26.61 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  29.65 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  31.68 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  25.73 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  24.2 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  24.24 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.37 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  23.74 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  23.23 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  28.57 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  27.45 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.31 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  29.22 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.03 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.92 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  25.93 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  25.98 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  22.69 
 
 		 484 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  33.07 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  39.47 
 
 		 351 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  36 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>