245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2301 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2301  FlhB domain-containing protein  100 
 
 
87 aa  173  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.05 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  45.88 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  47.44 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  41.25 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  43.53 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  43.59 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  39.76 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.84 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  41.38 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.47 
 
 
354 aa  58.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  42.67 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3472  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.45 
 
 
355 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  46.25 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  42.17 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  44.3 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.31 
 
 
363 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.05 
 
 
357 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.95 
 
 
381 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1214  type III secretion exporter  38.75 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.95 
 
 
392 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.51 
 
 
359 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  41.56 
 
 
369 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.67 
 
 
374 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  41.86 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  43.24 
 
 
380 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  36.14 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  44 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.87 
 
 
361 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  40.79 
 
 
355 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  40.79 
 
 
122 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  40.79 
 
 
355 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  40.79 
 
 
355 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.61 
 
 
350 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  34.57 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
356 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  39.29 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  40 
 
 
88 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  41.1 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  46.67 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.37 
 
 
357 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.74 
 
 
359 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.11 
 
 
387 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  40.96 
 
 
92 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.11 
 
 
387 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  44.05 
 
 
87 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.66 
 
 
353 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  41.33 
 
 
90 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.05 
 
 
353 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  37.33 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  36.59 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36 
 
 
354 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  38.55 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  38.27 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.71 
 
 
359 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  38.55 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.24 
 
 
373 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.11 
 
 
356 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.67 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  32.94 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
380 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  35 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.86 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.21 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0183  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.06 
 
 
399 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  39.51 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.86 
 
 
359 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  41.03 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.46 
 
 
351 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3443  type III secretion exporter  44 
 
 
358 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.942918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 
356 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.21 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  35.37 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  36.14 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  38.96 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2366  hypothetical protein  37.8 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  36.78 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.26 
 
 
359 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.66 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.89 
 
 
360 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.89 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  33.73 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  39.47 
 
 
387 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.79 
 
 
353 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.79 
 
 
350 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.96 
 
 
354 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1991  hypothetical protein  47.44 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.54 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  37.84 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>