More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2399 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  50 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  45.45 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  48.24 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  44.05 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  49.4 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  48.1 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  45.12 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  45.57 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  47.06 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  50 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  46.15 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  45.78 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44.09 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  45.35 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44.71 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  41.38 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  43.53 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  45.78 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  42.17 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  43.9 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  43.9 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  44.58 
 
 
87 aa  67  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  39 
 
 
381 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  45.45 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  42.35 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  47.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  47.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  41.25 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  47.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  45.21 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0267  flagellar biosynthesis  43.9 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  40.48 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  43.42 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  43.37 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  40.91 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  41.38 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  41.03 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  40.43 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  46.25 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  40.91 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  50 
 
 
392 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  41.25 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3765  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.94 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.943439 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  42.68 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  47.95 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  38.75 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  33.33 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  40.96 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  34.18 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0171  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.73 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  34.67 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.3 
 
 
366 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  32.93 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  36.78 
 
 
377 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.11 
 
 
358 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  40.96 
 
 
422 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  37.21 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.89 
 
 
359 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.57 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  40 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  31.71 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.57 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
362 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.86 
 
 
374 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2827  hypothetical protein  34.41 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.86 
 
 
374 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.08 
 
 
366 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.59 
 
 
360 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.48 
 
 
356 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  33.71 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.48 
 
 
357 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.11 
 
 
363 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.05 
 
 
361 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  33.33 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  35.8 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  35.63 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  35 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.48 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  37.97 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  40.51 
 
 
104 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  31.65 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2970  putative flagellar protein FhlB  35.8 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0147408  normal  0.125746 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
358 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  37.97 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.1 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.24 
 
 
368 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2445  putative flagellar protein FhlB  35.8 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3059  putative flagellar protein FhlB  35.8 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3078  putative flagellar protein FhlB  35.8 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>