More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2339 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  84.88 
 
 		 88 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  82.02 
 
 		 89 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  78.65 
 
 		 89 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  78.16 
 
 		 91 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  75.58 
 
 		 88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  60 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  60.76 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  50.59 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  50.59 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  50.59 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  51.28 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  55.42 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  47.62 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  47.25 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  54.67 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  58.97 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  46.91 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  50.6 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.66 
 
 		 366 aa  80.5  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  49.4 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  46.91 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  48.1 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  54.43 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  55.06 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  49.38 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  46.99 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  45.35 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.57 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  57.14 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  48.78 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  44.19 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.47 
 
 		 387 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  40.45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.47 
 
 		 387 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  43.02 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.76 
 
 		 380 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  45 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  46.34 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  50 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 		 357 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  53.66 
 
 		 422 aa  74.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 351 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  45.57 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.94 
 
 		 379 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  47.62 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  55.56 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  43.75 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  43.75 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  43.04 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  54.43 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.5 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  46.99 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.01 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.33 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  43.04 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  50 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  48.1 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  51.22 
 
 		 360 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  44.09 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  46.99 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  43.75 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 		 392 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.84 
 
 		 380 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  48 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  51.95 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  46.99 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  45.68 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  50.63 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  50 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.78 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.16 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.25 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  48.78 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3472  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.84 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.72 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.38 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  51.22 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  52.38 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  51.22 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.25 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.57 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  41.18 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  50.6 
 
 		 369 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.38 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  52.5 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>