More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3125 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 88 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  84.88 
 
 		 89 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  84.88 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  81.61 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  77.27 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  77.01 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  61.73 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  59.74 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  53.85 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  56.47 
 
 		 366 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  57.33 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  54.22 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  50.59 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  49.38 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  49.38 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  48.84 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  48.81 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  49.4 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  47.56 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  51.32 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  45.12 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  45.12 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  51.9 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  45.12 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  52.38 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.66 
 
 		 374 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.9 
 
 		 351 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  56.94 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  55.84 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  48.15 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  44.32 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  49.35 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  53.01 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.91 
 
 		 361 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  51.85 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  49.4 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  53.01 
 
 		 422 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  46.34 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.1 
 
 		 354 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  49.37 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.5 
 
 		 380 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  55 
 
 		 380 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  52.5 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.25 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.75 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.75 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  50 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  48.61 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  46.51 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.81 
 
 		 358 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  42.86 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  42.86 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  46.91 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  44.71 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  47.67 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  50 
 
 		 374 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  46.75 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.72 
 
 		 357 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  50 
 
 		 374 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.5 
 
 		 357 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  44.16 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.85 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  49.37 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.59 
 
 		 357 aa  70.5  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  52.5 
 
 		 360 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 		 392 aa  70.1  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  58.44 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  52.05 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  41.56 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  48.19 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.6 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  52.05 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  49.4 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  55.13 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.75 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  50 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  51.25 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  50.7 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  41.56 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  41.56 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.22 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  54.55 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.19 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  50 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  38.82 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.62 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>