More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0759 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  100 
 
 
94 aa  183  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  53.41 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  43.33 
 
 
94 aa  90.5  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0267  flagellar biosynthesis  45.88 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  49.35 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  47.62 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  42.22 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  43.53 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  44.3 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  44.3 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  46.91 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  44.3 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  44.09 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  48.15 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  48.1 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  48.65 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  45.57 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  44.16 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  54.93 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  34.12 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  47.3 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  50 
 
 
366 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  48 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  50.7 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  50.7 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  48 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  44.44 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  40.24 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  40.24 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  40.45 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  46.48 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  39.13 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  39.13 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  39.13 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  39.13 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  41.67 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  36.96 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  37.66 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  39.08 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  38.1 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.68 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0278  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.75 
 
 
372 aa  64.7  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.09 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1547  flagellar protein FhlB-like protein  37.66 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.178027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.3 
 
 
392 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  37.5 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  41.46 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.06 
 
 
361 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.59 
 
 
350 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.04 
 
 
355 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.21 
 
 
363 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  45.83 
 
 
360 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  35.8 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  50.68 
 
 
356 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  37.04 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  34.09 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  35 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  35.37 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2366  hypothetical protein  35.8 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.1 
 
 
353 aa  61.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1370  FlhB domain-containing protein  34.62 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.44 
 
 
366 aa  60.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  37.04 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3235  flagellar biosynthesis protein  37.18 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  33.7 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.44 
 
 
381 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  40 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3472  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.93 
 
 
355 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  34.48 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  39.02 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  32.61 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  39.77 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  39.77 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  39.08 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.44 
 
 
356 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.93 
 
 
357 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.35 
 
 
351 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  34.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  38.64 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  32.61 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.16 
 
 
384 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  35.56 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.31 
 
 
359 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  35.71 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  39.02 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6408  putative flagellar protein FhlB  32.58 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.15037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  32.93 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  32.61 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  34.18 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3104  putative flagellar protein FhlB  32.58 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.68 
 
 
373 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  40.26 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.74 
 
 
377 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1760  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  38.27 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000598623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  34.15 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>