More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1309 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  99.03 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  96.12 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  95.1 
 
 		 102 aa  196  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  87.38 
 
 		 103 aa  187  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  84.31 
 
 		 102 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  84.31 
 
 		 102 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  84.31 
 
 		 102 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  83.33 
 
 		 102 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  75.25 
 
 		 111 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  70.87 
 
 		 104 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  78.49 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  71.58 
 
 		 104 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  70.3 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  67.42 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  63.73 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  55.88 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  43.56 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  40.86 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  48.84 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  50.65 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  50.65 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  52.38 
 
 		 82 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  44.57 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  43.82 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  42.11 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  49.43 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  46.07 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  45.74 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  44.68 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  46.91 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  44.09 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  53.09 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  44.83 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  48.1 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  44.83 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  45.68 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  47.44 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  45.35 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  46.25 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  48.86 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  47.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  47.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  45.68 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  43.68 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  47.06 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  44.3 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  43.21 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  45.35 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  47.67 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3104  putative flagellar protein FhlB  43.53 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  51.95 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  44.58 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2827  hypothetical protein  45.68 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  44.74 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  42.35 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  41.98 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2970  putative flagellar protein FhlB  42.35 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0147408  normal  0.125746 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  45 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  46.99 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  40 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  41.75 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  42.7 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  44.44 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  42.17 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  43.53 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  44.94 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0227  putative flagellar biosynthesis protein  42.17 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2951  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.46 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  43.82 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0421  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  42.17 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0303064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0239  putative flagellar biosynthesis protein  42.17 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2137  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.46 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.406507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0205  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  40.96 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  37.5 
 
 		 108 aa  66.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.24 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  35.11 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  43.53 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3078  putative flagellar protein FhlB  40.48 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  39.08 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.3 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2445  putative flagellar protein FhlB  40.48 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3059  putative flagellar protein FhlB  40.48 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.68 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.98 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6408  putative flagellar protein FhlB  40.48 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.15037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  37.78 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3395  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  44 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3286  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  44 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  45.07 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  41.86 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  40.24 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>