68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1746 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1746  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  825    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0812  hypothetical protein  24.63 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0222713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.46 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  20.3 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.44 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.89 
 
 		 311 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.98 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.07 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.5 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.73 
 
 		 481 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  25.52 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  21.73 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.59 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  24.16 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.73 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.64 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09711  membrane bound transcriptional regulator-like protein  21.79 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.77 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  20.15 
 
 		 618 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.77 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0905  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.3 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.19 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.18 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.69 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.69 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  21.62 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.34 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  24.83 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.9 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1774  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.62 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0243051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.41 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.33 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.77 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.77 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.77 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.77 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  20.68 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2390  hypothetical protein  22.66 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.610760000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.05 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  21.43 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  24.58 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1106  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.58 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0413788  hitchhiker  0.0000000000000467776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.42 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.08 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.43 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.7 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.58 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  20.31 
 
 		 527 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  20.52 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.41 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.02 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  21.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  21.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  21.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.87 
 
 		 717 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.04 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  21.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  23.3 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1398  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.69 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2264  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.71 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  23.94 
 
 		 304 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.15 
 
 		 271 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.05 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>