51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11390 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11390  transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  53.11 
 
 		 1085 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 1137 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 1085 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  48.97 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11388  transcriptional regulator  43.65 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.865645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 		 532 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  26.58 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 664 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 471 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 		 680 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 667 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 		 647 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 878 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.08 
 
 		 738 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.06 
 
 		 598 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 		 648 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.61 
 
 		 631 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 652 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 		 612 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 		 633 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 626 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  32.53 
 
 		 907 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.52 
 
 		 622 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.77 
 
 		 568 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 647 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 597 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.52 
 
 		 622 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.87 
 
 		 595 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  36.9 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.81 
 
 		 568 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.65 
 
 		 629 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.35 
 
 		 723 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.64 
 
 		 431 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.7 
 
 		 588 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 		 449 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 		 449 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 		 150 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 		 449 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  24.87 
 
 		 441 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>