More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11050 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11050  two component system sensor histidine kinase trcS  100 
 
 		 509 aa  1021    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 552 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  41.03 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  45.72 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  43.27 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  44.96 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 509 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  39.64 
 
 		 494 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  36.69 
 
 		 497 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  38.1 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 510 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 534 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  44.41 
 
 		 469 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 524 aa  203  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.01 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  34.6 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 479 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  37.58 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  35.37 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  36.86 
 
 		 477 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5254  histidine kinase  38.25 
 
 		 545 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 365 aa  166  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 503 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  40.45 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  40.33 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  41.89 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  34.59 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  35.81 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  35.36 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 505 aa  154  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  38.13 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 545 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  41.23 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 529 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 635 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  37.54 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 504 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.14 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  36.36 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 815 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.59 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.61 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 		 648 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.59 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 471 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.54 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 816 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  38.86 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 475 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  38.27 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>