More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10660 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  84.04 
 
 
451 aa  777    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0972  hypothetical protein  83.26 
 
 
452 aa  765    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10660  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0203819  normal  0.0597798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  83.14 
 
 
455 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  83.41 
 
 
455 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0954  hypothetical protein  83.26 
 
 
452 aa  765    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4556  ABC-1 domain protein  55.42 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  36.75 
 
 
464 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.73 
 
 
573 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1092  ABC-1 domain protein  37.53 
 
 
559 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.444876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.15 
 
 
558 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.09 
 
 
517 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.49 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  33.51 
 
 
423 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.83 
 
 
517 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 
558 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.15 
 
 
558 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.58 
 
 
562 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.05 
 
 
520 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.32 
 
 
557 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.17 
 
 
534 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.57 
 
 
509 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.65 
 
 
591 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.94 
 
 
557 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.58 
 
 
556 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.62 
 
 
534 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.38 
 
 
525 aa  192  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.23 
 
 
527 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  32.35 
 
 
542 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.25 
 
 
558 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.73 
 
 
520 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 
537 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.62 
 
 
547 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.98 
 
 
565 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.98 
 
 
565 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.73 
 
 
521 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34.96 
 
 
550 aa  187  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.13 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.24 
 
 
523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.05 
 
 
559 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  30.23 
 
 
585 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  31.2 
 
 
563 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21207  predicted protein  32.93 
 
 
517 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.67 
 
 
509 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  31.98 
 
 
397 aa  183  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.33 
 
 
520 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  30.16 
 
 
572 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.32 
 
 
592 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.88 
 
 
511 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 
522 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  29.19 
 
 
549 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.54 
 
 
555 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.97 
 
 
551 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.92 
 
 
524 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  29.19 
 
 
549 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  31.54 
 
 
560 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  32.63 
 
 
582 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.05 
 
 
546 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  31.36 
 
 
453 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.44 
 
 
525 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1015  hypothetical protein  30.87 
 
 
432 aa  179  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662027  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.27 
 
 
561 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.69 
 
 
530 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 
572 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  32.58 
 
 
543 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.65 
 
 
519 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.23 
 
 
514 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.46 
 
 
514 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.15 
 
 
571 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.32 
 
 
559 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.53 
 
 
554 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.64 
 
 
533 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.64 
 
 
533 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.71 
 
 
524 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.42 
 
 
525 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.68 
 
 
529 aa  177  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
549 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  32.01 
 
 
556 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.62 
 
 
540 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.07 
 
 
539 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  30.13 
 
 
578 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.38 
 
 
524 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
544 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.14 
 
 
508 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.07 
 
 
539 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.27 
 
 
527 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  32.01 
 
 
543 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.03 
 
 
551 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.62 
 
 
557 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.56 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.05 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  29.23 
 
 
665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.54 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  32 
 
 
559 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  28.72 
 
 
666 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.38 
 
 
518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
689 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.51 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  28.72 
 
 
659 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>