More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0954 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  89.06 
 
 
451 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  85.4 
 
 
455 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10660  hypothetical protein  83.26 
 
 
488 aa  765    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0203819  normal  0.0597798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0972  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  98.02 
 
 
455 aa  905    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0954  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4556  ABC-1 domain protein  53.72 
 
 
456 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  37.65 
 
 
464 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  33.1 
 
 
423 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1092  ABC-1 domain protein  35.34 
 
 
559 aa  209  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.444876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.22 
 
 
558 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.65 
 
 
573 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
562 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
558 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
558 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.66 
 
 
558 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.11 
 
 
557 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.16 
 
 
537 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  31.6 
 
 
542 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.06 
 
 
517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.32 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 
565 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 
565 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.31 
 
 
523 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  31.89 
 
 
397 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 
552 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21207  predicted protein  34.36 
 
 
517 aa  192  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.22 
 
 
520 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.41 
 
 
534 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.65 
 
 
534 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.6 
 
 
550 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.34 
 
 
525 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  30.25 
 
 
549 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.88 
 
 
520 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  29.97 
 
 
549 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.65 
 
 
561 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.52 
 
 
543 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.02 
 
 
557 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  30.38 
 
 
585 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.68 
 
 
546 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.88 
 
 
521 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.44 
 
 
558 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.43 
 
 
534 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  33.97 
 
 
543 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  33.97 
 
 
556 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.58 
 
 
556 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.28 
 
 
511 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.38 
 
 
509 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  32.29 
 
 
453 aa  187  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  32.46 
 
 
541 aa  187  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.35 
 
 
547 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.11 
 
 
578 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.89 
 
 
561 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.98 
 
 
525 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.23 
 
 
520 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.54 
 
 
527 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.44 
 
 
524 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.59 
 
 
559 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.58 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.63 
 
 
584 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1015  hypothetical protein  31.88 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662027  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.14 
 
 
530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.17 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.49 
 
 
555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.68 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.97 
 
 
563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.66 
 
 
539 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  30.14 
 
 
572 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.87 
 
 
509 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1232  protein kinase  31.51 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.26 
 
 
561 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.24 
 
 
553 aa  183  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.7 
 
 
551 aa  182  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 
571 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.52 
 
 
553 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 
558 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.25 
 
 
561 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.69 
 
 
539 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.47 
 
 
547 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  28.72 
 
 
549 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.17 
 
 
554 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.89 
 
 
592 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  32.09 
 
 
560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.24 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.24 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.17 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.38 
 
 
524 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.13 
 
 
509 aa  180  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.95 
 
 
559 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.25 
 
 
559 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
572 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.47 
 
 
533 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.71 
 
 
524 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.64 
 
 
514 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.1 
 
 
524 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.33 
 
 
529 aa  179  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.52 
 
 
539 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.47 
 
 
533 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.33 
 
 
552 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.13 
 
 
519 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>