More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4556 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4556  ABC-1 domain protein  100 
 
 
456 aa  913    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0954  hypothetical protein  52.73 
 
 
452 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0972  hypothetical protein  52.73 
 
 
452 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  52.94 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  53.41 
 
 
451 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10660  hypothetical protein  54.74 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0203819  normal  0.0597798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  51.12 
 
 
455 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  37.91 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.29 
 
 
558 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.7 
 
 
558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1092  ABC-1 domain protein  38.9 
 
 
559 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.444876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
558 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  31.89 
 
 
453 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.43 
 
 
573 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.01 
 
 
557 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.01 
 
 
558 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.87 
 
 
557 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.24 
 
 
557 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21207  predicted protein  34.15 
 
 
517 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  30.34 
 
 
423 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.02 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.41 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  33.42 
 
 
397 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1232  protein kinase  31.67 
 
 
451 aa  200  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.22 
 
 
562 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.15 
 
 
530 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  35.11 
 
 
559 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1015  hypothetical protein  31.83 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662027  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.78 
 
 
558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.63 
 
 
519 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.82 
 
 
525 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.34 
 
 
520 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.71 
 
 
556 aa  192  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.57 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
549 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.09 
 
 
520 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34.57 
 
 
550 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.09 
 
 
521 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.2 
 
 
517 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  31.38 
 
 
547 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.55 
 
 
514 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.5 
 
 
520 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.25 
 
 
549 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.22 
 
 
522 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  34.22 
 
 
565 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.37 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.84 
 
 
534 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.67 
 
 
517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.65 
 
 
549 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.05 
 
 
552 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.36 
 
 
524 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.92 
 
 
523 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.71 
 
 
563 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.11 
 
 
524 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  30.36 
 
 
549 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
599 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.1 
 
 
555 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.07 
 
 
546 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  32.88 
 
 
545 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.6 
 
 
542 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.24 
 
 
537 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.26 
 
 
511 aa  181  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.3 
 
 
547 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.25 
 
 
561 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  31.69 
 
 
620 aa  179  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.89 
 
 
549 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.47 
 
 
509 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.55 
 
 
565 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.5 
 
 
527 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.03 
 
 
518 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.55 
 
 
565 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.62 
 
 
549 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.84 
 
 
561 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 
585 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.62 
 
 
549 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.64 
 
 
549 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  28.8 
 
 
549 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.62 
 
 
549 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.28 
 
 
549 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.62 
 
 
549 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  29.59 
 
 
549 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.99 
 
 
534 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.31 
 
 
559 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.42 
 
 
506 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.68 
 
 
524 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  34.25 
 
 
563 aa  176  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.27 
 
 
559 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.46 
 
 
563 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  28.53 
 
 
549 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.6 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  31.89 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  27.04 
 
 
586 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.1 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.19 
 
 
551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.13 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.73 
 
 
534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.59 
 
 
525 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  32.07 
 
 
543 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.79 
 
 
556 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.99 
 
 
559 aa  173  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>