More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1419 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1419  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3939  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  88.81 
 
 
286 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1532  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  91.97 
 
 
288 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185742  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2306  light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  89.79 
 
 
288 aa  491  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2332  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  91.94 
 
 
307 aa  490  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2375  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  88.81 
 
 
304 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0819  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  89.67 
 
 
289 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.147693  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0791  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  89.67 
 
 
289 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
296 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
296 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.51 
 
 
312 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6414  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  56.23 
 
 
301 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.53 
 
 
296 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.82 
 
 
319 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.44 
 
 
299 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.51 
 
 
312 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
296 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.2 
 
 
297 aa  295  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.15 
 
 
296 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.58 
 
 
297 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05691  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
295 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.58 
 
 
297 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
295 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
295 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.57 
 
 
273 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.57 
 
 
273 aa  291  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.91 
 
 
299 aa  291  8e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.91 
 
 
295 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.7 
 
 
273 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.2 
 
 
297 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
276 aa  289  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3721  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.58 
 
 
301 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0606642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.05 
 
 
297 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
297 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
276 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
297 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.14 
 
 
275 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.82 
 
 
301 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.03 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
275 aa  282  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
275 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
275 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1316  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.89 
 
 
312 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.75 
 
 
312 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469245  hitchhiker  0.00416412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.58 
 
 
295 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2039  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
302 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  37.96 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  39 
 
 
324 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  37.55 
 
 
292 aa  175  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  40 
 
 
272 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  36.2 
 
 
313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  37.84 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  39.29 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  36.92 
 
 
292 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  43.04 
 
 
731 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.05 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  34.93 
 
 
292 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  44.74 
 
 
251 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  37.45 
 
 
289 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  37.07 
 
 
289 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  35.84 
 
 
292 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  40.38 
 
 
290 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  37 
 
 
273 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  41.48 
 
 
290 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  36.26 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  39 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.69 
 
 
268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  37.87 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.46 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  37.07 
 
 
299 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  37.13 
 
 
298 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  37.13 
 
 
275 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  36.76 
 
 
275 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.73 
 
 
284 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  42.17 
 
 
272 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  36.67 
 
 
272 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.52 
 
 
296 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
299 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
299 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  35.94 
 
 
293 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  35.66 
 
 
299 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.17 
 
 
248 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  36.73 
 
 
274 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.72 
 
 
296 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  37.93 
 
 
274 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  35.97 
 
 
277 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  36.76 
 
 
290 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  35.52 
 
 
288 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  36.03 
 
 
299 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  33.7 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  35.29 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  39.13 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  37.36 
 
 
295 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.88 
 
 
296 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.98 
 
 
289 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  36.16 
 
 
326 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  37.45 
 
 
288 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  36.78 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  41.78 
 
 
728 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>