45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1043 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  56.52 
 
 		 236 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  55.34 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  52.73 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  54.82 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  39.38 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  36.46 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  37.68 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  38.55 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  40.1 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  40.11 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  34.38 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  32.16 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  34.27 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.85 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  27.94 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.22 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  28.1 
 
 		 444 aa  58.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.41 
 
 		 525 aa  52  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  26.5 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  27.86 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.68 
 
 		 526 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  31.15 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  26.4 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  29.66 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  38.3 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  28.5 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  22.33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  22.28 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  29.74 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.9 
 
 		 521 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  31.87 
 
 		 387 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>