36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2225 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  72.22 
 
 		 237 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  70.46 
 
 		 237 aa  362  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  71.05 
 
 		 237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 		 275 aa  121  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  31.18 
 
 		 719 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  27.04 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  27.71 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  25.98 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  28.72 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  26.64 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  27.54 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  27.54 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  29.13 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  27.36 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  36.63 
 
 		 1011 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  30.33 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.31 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.93 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3113  hypothetical protein  27.96 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0147985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  30.7 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  30.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  26.5 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  34.41 
 
 		 410 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  33.87 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.59 
 
 		 525 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  27.08 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  33.6 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  26.29 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.16 
 
 		 526 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  23.72 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>