48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2240 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  64.22 
 
 
225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  63.76 
 
 
225 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  60.55 
 
 
244 aa  268  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  58.45 
 
 
236 aa  257  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  56.25 
 
 
235 aa  255  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  54.55 
 
 
232 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  54.82 
 
 
217 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  37.5 
 
 
217 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  36.96 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  33.02 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  39.77 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  37.57 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  36.76 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  33.66 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  31.28 
 
 
213 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  36.51 
 
 
195 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.67 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  29.78 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  30.35 
 
 
444 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  26.22 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  28.72 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.23 
 
 
516 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.2 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  26.34 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  25.13 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  26.37 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  24.73 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  27.4 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  24.49 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.31 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  32.31 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
269 aa  48.5  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.71 
 
 
521 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
204 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.48 
 
 
509 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.94 
 
 
526 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  21.21 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  30 
 
 
526 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  30.1 
 
 
387 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0415  hypothetical protein  26.73 
 
 
206 aa  41.6  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.270838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>