30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0424 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
275 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  31.35 
 
 
237 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
237 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  31.52 
 
 
251 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  32.32 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  33.76 
 
 
227 aa  85.5  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  26.22 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  29 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  26.07 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  25.64 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  25.57 
 
 
232 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  27.8 
 
 
719 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  29.27 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  26.38 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.24 
 
 
217 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.05 
 
 
525 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  27.31 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  29.81 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  32.08 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.77 
 
 
526 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  58.33 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  28.93 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  25.33 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  25.22 
 
 
444 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>