33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2717 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  100 
 
 
208 aa  413  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0415  hypothetical protein  27.98 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.270838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  29.59 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  26.87 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  26.6 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  29.1 
 
 
237 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  27.23 
 
 
217 aa  52  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  24.49 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  31.06 
 
 
562 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.21 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  26.06 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  26.11 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  28.93 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  26.32 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  26.4 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  29.03 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  27.23 
 
 
197 aa  48.5  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  35.48 
 
 
387 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  24.12 
 
 
244 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  28.06 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  27.83 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  26.06 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  30 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  25.97 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.39 
 
 
234 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  25.91 
 
 
201 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  24.49 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  24.49 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  29.63 
 
 
251 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  26.48 
 
 
1011 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
275 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>