43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3224 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  99.56 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  63.76 
 
 		 227 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  58.53 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  53.3 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  53.49 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  55 
 
 		 236 aa  228  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  42.93 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  38.89 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  41.11 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  41.11 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  34.12 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  36.16 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  34.41 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  31.98 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  32.55 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.87 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  34.03 
 
 		 147 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.38 
 
 		 516 aa  71.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  28.12 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  26.07 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  27.78 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.39 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.12 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  26.76 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  26.91 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 444 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  26.24 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.35 
 
 		 526 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  26.47 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.7 
 
 		 521 aa  48.5  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  24.61 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  34.78 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.63 
 
 		 525 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  24.49 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.33 
 
 		 509 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  30.53 
 
 		 526 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  35.87 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  25 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.406511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>