27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2294 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  66.49 
 
 
195 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  54.4 
 
 
201 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  53.26 
 
 
217 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  53.26 
 
 
217 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  53.23 
 
 
223 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  34.48 
 
 
213 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  36.13 
 
 
213 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  36.32 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
232 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 
225 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 
225 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  38.05 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  27.94 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
197 aa  52  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.08 
 
 
525 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  27.72 
 
 
444 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  26.42 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  29.03 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.57 
 
 
516 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>