91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0743 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  100 
 
 		 525 aa  1045    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  73.95 
 
 		 526 aa  726    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  73.71 
 
 		 526 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  67.3 
 
 		 526 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  61.84 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  60.34 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08260  conserved hypothetical protein TIGR00297  41 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  40.44 
 
 		 277 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2743  hypothetical protein  40.73 
 
 		 285 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1824  hypothetical protein  35.74 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.57 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.92 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.24 
 
 		 257 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  28.79 
 
 		 408 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4884  hypothetical protein  35.43 
 
 		 273 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  26.89 
 
 		 470 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  29.63 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  27.5 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.13 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  31.62 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1573  hypothetical protein  29.17 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  24.19 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  30 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  29.09 
 
 		 247 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0829  hypothetical protein  31.29 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0182  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.649357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  27.43 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6328  predicted protein  30.04 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171794  hitchhiker  0.00792458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  24.55 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1613  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  27.93 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07821  hypothetical protein  28.37 
 
 		 263 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598038 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  26.03 
 
 		 245 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  28.93 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  26.26 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.19 
 
 		 250 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  29.73 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1546  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.28 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  26.09 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1205  hypothetical protein  28.78 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  26.7 
 
 		 223 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  28.19 
 
 		 234 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3253  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.68 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  27.08 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1227  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.5 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  24.66 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  24.63 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  24.66 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  28.64 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_006686  CND01270  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.824166  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  27.32 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  27.03 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  27.4 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10054  predicted protein  28.9 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  30.21 
 
 		 195 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4686  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.09 
 
 		 247 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.347886  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  27.4 
 
 		 237 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2185  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.89 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0972552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  27.92 
 
 		 213 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  24.26 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  26.34 
 
 		 217 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  25.63 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  26.98 
 
 		 213 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  26.87 
 
 		 244 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  25.21 
 
 		 225 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  27.57 
 
 		 275 aa  54.3  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1453  hypothetical protein  24.87 
 
 		 252 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  25.52 
 
 		 237 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5222  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.5 
 
 		 262 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  28.67 
 
 		 147 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  24.29 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  27.64 
 
 		 236 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  25.45 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 235 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  25.12 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5597  predicted protein  27.31 
 
 		 249 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3558  hypothetical protein  22.71 
 
 		 261 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0151  hypothetical protein  27.88 
 
 		 238 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0192  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.58 
 
 		 447 aa  50.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23959  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  25.89 
 
 		 213 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  27.85 
 
 		 227 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.56 
 
 		 237 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.13 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3203  hypothetical protein  33.96 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.13 
 
 		 248 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  22.06 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  25.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 236 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38754  predicted protein  28 
 
 		 195 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>