92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2165 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  75.48 
 
 
526 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  73.95 
 
 
525 aa  768    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  70.72 
 
 
526 aa  680    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  100 
 
 
526 aa  1047    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  67.35 
 
 
509 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  63.67 
 
 
521 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08260  conserved hypothetical protein TIGR00297  39.31 
 
 
281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  39.37 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1824  hypothetical protein  35.25 
 
 
306 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2743  hypothetical protein  40.82 
 
 
285 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.82 
 
 
259 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  36.02 
 
 
257 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  32.45 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.61 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4884  hypothetical protein  34.26 
 
 
273 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  27.2 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  26.79 
 
 
470 aa  84  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  26.48 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  26.36 
 
 
245 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  27.09 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  30.58 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0182  hypothetical protein  29.58 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.649357 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  30.46 
 
 
250 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  28.18 
 
 
236 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1613  hypothetical protein  29.51 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.93 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1573  hypothetical protein  29.28 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  25.1 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0829  hypothetical protein  29.3 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6328  predicted protein  30.31 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171794  hitchhiker  0.00792458 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  24.1 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07821  hypothetical protein  27.27 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  27.68 
 
 
237 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1546  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.11 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.82 
 
 
250 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  25.84 
 
 
247 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  26.34 
 
 
225 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  25.84 
 
 
247 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1205  hypothetical protein  27.94 
 
 
245 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3253  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  28.35 
 
 
237 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  25.93 
 
 
225 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  25.34 
 
 
248 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  27.91 
 
 
237 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  28.37 
 
 
237 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  27.63 
 
 
232 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
234 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  27.69 
 
 
227 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  27.98 
 
 
275 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  22.51 
 
 
444 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  25.44 
 
 
213 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1227  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.23 
 
 
447 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2185  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.18 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0972552  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
235 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4686  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.3 
 
 
247 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.347886  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  24.4 
 
 
244 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  25.36 
 
 
257 aa  57  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  26.5 
 
 
237 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  27.7 
 
 
217 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5222  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.21 
 
 
262 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  23.33 
 
 
265 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.74 
 
 
248 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.87 
 
 
237 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  24.75 
 
 
213 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.24 
 
 
248 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1453  hypothetical protein  27.15 
 
 
252 aa  53.9  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  25.25 
 
 
249 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  26.99 
 
 
216 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  26.83 
 
 
237 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3558  hypothetical protein  24.15 
 
 
261 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523152  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  23.5 
 
 
223 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  24.41 
 
 
227 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  24.78 
 
 
213 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  26.61 
 
 
236 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  26.52 
 
 
147 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10054  predicted protein  28.57 
 
 
259 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  25.12 
 
 
217 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.45 
 
 
237 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3203  hypothetical protein  35.85 
 
 
236 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01270  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
246 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.824166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0151  hypothetical protein  27.71 
 
 
238 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  27.1 
 
 
234 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  24.64 
 
 
217 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0192  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.23 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23959  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38754  predicted protein  30.46 
 
 
195 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5597  predicted protein  25.64 
 
 
249 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  27.14 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  25.5 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0166  hypothetical protein  28.85 
 
 
245 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>