33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1791 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  92.02 
 
 
213 aa  370  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  67.45 
 
 
213 aa  290  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  93.2 
 
 
147 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  45.45 
 
 
223 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  38.14 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  37.31 
 
 
195 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  34.78 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  43.48 
 
 
217 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  42.93 
 
 
217 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 
232 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  33.02 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  35.58 
 
 
236 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  34.12 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.16 
 
 
244 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  32.06 
 
 
217 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  29.49 
 
 
237 aa  84.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  24.55 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.27 
 
 
516 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  24.42 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.65 
 
 
521 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  22.66 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.03 
 
 
525 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  35.94 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.45 
 
 
526 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  27.03 
 
 
526 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  24 
 
 
444 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.12 
 
 
509 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  23.67 
 
 
251 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  30.08 
 
 
275 aa  41.6  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>