28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1450 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  28.57 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  32.04 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  29.93 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  29.17 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  28.5 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
237 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  22.66 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  30.43 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  21.46 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  21.99 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  28.43 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  27.6 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  23.5 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  27.43 
 
 
244 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  22.54 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25.33 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  26.37 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  38.04 
 
 
516 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
223 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  29.82 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  29.82 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>